世界卫生组织流感大流行警示维持在6级，严重程度为中等；本澳警示级别为第6级蓝色，本地疫情为一般。目前本地甲型H1N1流感累积个案为1045例。 9月1日至2日下午，卫生局共录得44例甲型H1N1新增确诊个案。患者包括23名男性和21名女性，年龄最大59岁，最小3岁。其中2009年暑期活动飞鹰计划军训营第四期2日有2名学员确诊感染；位於路环的圣路济亚中心有3名院友与1名工友确诊感染；另，飞良绍街地下的少年督课中心小4班有3名学童确诊感染，目前该班已停课。卫生局正在跟进各患者及密切接触者的健康状况。
自9月1日至2日下午，再有5名确诊患者经治疗后出院，另有6名确诊患者正在医院接受治疗，目前大部份病人一般状况良好及稳定。 另外，1名於 8月18日由镜湖医院转往仁伯爵综合医院深切治疗部的女性危重病人，经医务人员全力抢救无效，於9月2日中午不治。该名中年女性患者发病之病徵为反复发烧及咽喉痛约八天，起初於急诊治疗无效，之后病情恶化，再次求诊於镜湖医院；后确诊为甲型H1N1流感，有双侧肺炎以及呼吸衰竭，而转往仁伯爵综合医院深切治疗部。患者住院后病情持续危重，神志迷糊不清，血压不稳，呼吸衰竭严重，一直需要呼吸机持续使用高浓度氧气治疗、高浓度升压药及强心剂维持血压，但临床上呼吸衰竭仍不断恶化并出现败血症。至9月2日上午，患者病情再次转差，经医务人员再次对其施行心肺复苏术抢救无效，於中午12时05分不治死亡。
