对於廉政公署揭发多名由卫生局聘请的医疗辅助队队员涉嫌触犯伪造文件罪及诈骗罪等。卫生局表示，会继续积极配合廉政公署的调查，绝不姑息违法人员。同时，致力提高员工的廉洁意识和加强出勤监管。 因应2003年非典型肺炎(SARS)暴发，卫生局於2003年6月起成立医疗辅助队，主要负责替口岸旅客量度体温等预防SARS工作。其后，因应各种传染病的暴发，为有效及持续预防疫情，医疗辅助队继续相关的量度体温工作，直至2011年6月30日，基於疫情有所缓和，邻近地区亦取消对入境人士进行体温检测的做法，卫生局综合评估各种因素后，决定结束口岸测温工作，随即解散医疗辅助队，而涉案人员亦已离职。 卫生局强调，早已意识到要加强出勤监管，2010年9月便试行第一阶段电子打卡系统，该系统於2011年12月完成试行。经收集部门回馈意见后，下月开始於局内将全面实施电子打卡制度。
