在《完善医疗系统建设方案》公布后，卫生局已随即着手开展离岛医疗综合体的整体规划工作。离岛医疗综合体具有设施规模巨大、各种服务部门繁多、现代化规格程度高、医疗设备先进高端等特点。 由於本地没有相关大型医疗设施的建设经验，必须进行详细审慎的研究以决定整体的建造方案。故此卫生局在起始阶段努力寻求多方（包括香港、新加坡、以及美国、澳洲公司等）的资讯和意见，综合并详细分析各方建议，并聘请了国际专业顾问公司协助设计建造大纲，力求为本地建造一个满足未来廿五年至三十年医疗发展需要的大型现代化医疗设施。 离岛医疗综合体原计划分三期进行，后来，经美国医疗规划专家顾问公司研究及分析，整体工程规划不宜将每项工程作独立设计及建造，例如原计划首先建成的急诊大楼会因配套设施不足而运作困难，而且离岛医疗综合体所有组成部份都存有互相依赖互相配合的功能关连，第一期第二期工程应同步进行且更节省时间，故有必要重新检讨综合体的整体工程规划，在维持工程质量的同时，力争配合公布的时间表落实建设方案，与此同时，会继续与专家保持沟通，优化建设规划，争取多项建设可同步进行，并在其他优化规划推出前，尽快向公众公布。 卫生局也会根据顾问公司的建议，将原来方案分别於2014年和2017年落成的第一期第二期合并为一期工程，即急诊大楼和综合医院同时兴建，两期合并工程可望按照原来计划於2017年底完成。而在此前，卫生局亦进行了一系列的补足措施，如在科大医院内设置了离岛急诊站，向离岛市民提供急症服务；仁伯爵综合医院急诊大楼已落成即将提供服务；嘉模卫生中心亦将於2014下半年落成投入服务，区内的医疗服务将不断优化。 此外，石排湾临时卫生站已落成使用，岗顶传染病康复中心、前线人员宿舍亦在兴建当中，综合服务大楼和路环卫生站已完成设计待批核，其他项目亦有序开展。
