除了使用澳門特別行政區徽號外，各部門、機構以及從事對公眾造成影響的特別活動的從屬機構及附屬單位，得獲准使用專有標誌，以便快捷及明確對其作出識別（第5/98/M號法令第五條第三款）。
標誌應透過代表性成分及形象，以美觀的圖示方式表現部門、機構或附屬單位的性質、職責或主要活動，其核准須透過附說明理由的提議，並聽取行政公職局意見（第5/98/M號法令第五條第四款及第五款）。
政府部門及實體的標誌，由公佈於《澳門特別行政區公報》的行政命令核准及修改（經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規第九條第一款）。
以下幾頁會介紹一些部門或實體所使用的標誌。
| 廉政公署 | 二OO九年二月九日 澳門特別行政區 第3/2009號行政法規 |
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| 審計署 | 二OO七年五月二十八日 澳門特別行政區 第12/2007號行政法規 |
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| 政策研究和區域發展局 | 二O一九年四月八日 澳門特別行政區 第76/2019號行政命令 |
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| 澳門基金會 | 二OO三年九月二十九日 澳門特別行政區 第35/2003號行政命令 |
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| 新聞局 | 二OO二年十二月九日 澳門特別行政區 第31/2002號行政命令 |
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| 市政署 | 二O一八年九月三日 澳門特別行政區 第98/2018號行政命令 |
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| 退休基金會 | 二OO六年十一月二十日 澳門特別行政區 第16/2006號行政法規 |
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| 法律及司法培訓中心 | 二OO一年十月二十二日 澳門特別行政區 第44/2001號行政命令 |
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| 公共行政福利基金 | 二O二二年七月十八日 澳門特別行政區 第30/2022號行政法規 |
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| 財政局 | 二OO一年九月二十四日 澳門特別行政區 第37/2001號行政命令 |
 
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| 旅遊局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 博彩監察協調局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 勞工事務局 | 二OO四年七月二十六日 澳門特別行政區 第21/2004號行政命令 |
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| 招商投資促進局 | 二O二四年七月一日 澳門特別行政區 第35/2024號行政命令 |
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| 澳門金融管理局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 及 二OO一年五月七日 澳門特別行政區 第17/2001號行政命令 |
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| 汽車及航海保障基金 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 科學技術發展基金 | 二OO五年一月十日 澳門特別行政區 第1/2005號行政命令 |
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| 經濟及科技發展局 | 二O二一年八月九日 澳門特別行政區 第31/2021號行政命令 |
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| 統計暨普查局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 警察總局 | 二OO一年四月十六日 澳門特別行政區 第15/2001號行政命令 |
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| 澳門特別行政區海關 | 二OO一年十一月一日 澳門特別行政區 經第2/2022號行政法規修改並重新公佈的第21/2001號行政法規 |
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| 治安警察局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 司法警察局 | 二O二一年三月二十九日 澳門特別行政區 第52/2021號行政長官批示 |
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| 消防局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 懲教管理局 | 二O一六年八月一日 澳門特別行政區 第45/2016號行政命令 |
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| 澳門保安部隊事務局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 澳門保安部隊高等學校 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 治安警察局福利會 | 二O一四年三月十日 澳門特別行政區 第12/2014號行政命令 |
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| 教育及青年發展局 | 二O二一年一月四日 澳門特別行政區 第1/2021號行政命令 |
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| 文化體育局 | 二O二六年十月二十九日 澳門特別行政區 第86/2026號行政命令 |
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| 澳門博物館 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 衛生局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 仁伯爵綜合醫院 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 醫學專科學院 | 二O一八年十二月二十七日 澳門特別行政區 第118/2018號行政命令 |
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| 捐血中心 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 離島醫療綜合體 北京協和醫院澳門醫學中心 |
二O二三年十月五日 澳門特別行政區 第78/2023號行政命令 |
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| 社會工作局 | 二O一二年二月二十七日 澳門特別行政區 第10/2012號行政命令 |
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| 社會保障基金 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 澳門大學 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 澳門理工大學 | 二O二二年二月二十八日 澳門特別行政區 第10/2022號行政命令 |
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| 澳門旅遊大學 | 二O二四年三月二十五日 澳門特別行政區 第11/2024號行政命令 |
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| 土地工務局 | 二O二六年五月二十六日 澳門特別行政區 第35/2026號行政命令 |
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| 公共建設局 | 二O二六年五月二十六日 澳門特別行政區 第34/2026號行政命令 |
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| 海事及水務局 | 二O一三年十二月二十六日 澳門特別行政區 第119/2013號行政命令 |
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| 政府船塢 | 二O一三年十二月二十六日 澳門特別行政區 第119/2013號行政命令 |
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| 海事博物館 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 航海學校 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 環境保護局 | 二O一O年七月二十六日 澳門特別行政區 第62/2010號行政命令 |
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| 交通事務局 | 二OO九年七月二十日 澳門特別行政區 第31/2009號行攻命令 |
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| 民航局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 郵電局 (只應用於郵政範疇) |
一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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| 郵電局 | 二O一六年十二月三十日 澳門特別行政區 第80/2016號行政命令 |
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| 通訊博物館 | 二O一八年四月三日 澳門特別行政區 第57/2018號行政命令 |
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| 郵政儲金局 | 二O一七年十二月十一日 澳門特別行政區 第113/2017號行政命令 |
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| 房屋局 | 一九九九年十二月二十日 澳門特別行政區 經第2/2021號行政法規修改並重新公佈的第6/1999號行政法規 |
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